Počínaje rokem 2000 se Gymnázium Jaroslava Heyrovského stalo jedním z účastníků projektu Socrates-Comenius, jehož cílem je posílení myšlenky integrace a prohloubení zájmu studentů o problematiku odstraňování hranic. První akcí tohoto projektu byl seminář "Evropa mezi integrací a odstraňováním hranic", který proběhl od 13. do 19.února 2000 v dolnosaském školicím centru Sonnenberg. Pracovního setkání se zúčastnilo 14 studentů kvart Gymnázia Jaroslava Heyrovského z Prahy 13, dalšími účastníky byli studenti polského gymnázia v Glogowě a německé školy v Langenhagenu.

Dílčí témata semináře zněla :

"Jsme Němci, Češi, Poláci, Evropané, co to pro nás znamená?", "Co se mi na Západě (ne)líbí a co by Západ měl přijmout od Východu", nebo "Kdo patří k Evropě". Vlastní zpracování jednotlivých problémů mělo podobu písemnou či verbální, nejvíce však děti vyjadřovaly své názory formou výtvarnou. Děti pracovaly buď v mezinárodních či naopak národních skupinkách, vždy v závislosti na povaze zadaného úkolu. V rámci semináře tak účastníci připravili předvolební kampaň stran, jež se lišily pohledem na další rozšíření EU, prodiskutovali všednodennost a možnosti trávení volného času "-náctiletých" v jednotlivých zemích, formou koláží znázorňovali předsudky, jež chová jejich národ k ostatním zúčastněným národnostem, nebo hledali prvky, které zúčastněné země spojují či naopak rozdělují. V závěru setkání se pomocí filmu, koláže, plastiky nebo hudby pokusili vyjádřit své vize a obavy týkající se budoucnosti.